Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Surf4Q64310 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Surf4Q64310 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms