Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ifit1Q64282 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifit1Q64282 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms