Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lcn3Q62471 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms