Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga3Q62470 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms