Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vat1Q62465 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vat1Q62465 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms