Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epha6Q62413 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms