Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tff3Q62395 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms