Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sall3Q62255 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Sall3Q62255 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sall3Q62255 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms