Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SnrpaQ62189 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SnrpaQ62189 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SnrpaQ62189 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SnrpaQ62189 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SnrpaQ62189 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SnrpaQ62189 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SnrpaQ62189 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SnrpaQ62189 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SnrpaQ62189 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SnrpaQ62189 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SnrpaQ62189 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SnrpaQ62189 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SnrpaQ62189 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SnrpaQ62189 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SnrpaQ62189 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SnrpaQ62189 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SnrpaQ62189 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SnrpaQ62189 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SnrpaQ62189 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SnrpaQ62189 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SnrpaQ62189 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SnrpaQ62189 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SnrpaQ62189 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SnrpaQ62189 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SnrpaQ62189 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SnrpaQ62189 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms