Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ssr4Q62186 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssr4Q62186 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms