Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SspnQ62147 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SspnQ62147 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SspnQ62147 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SspnQ62147 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SspnQ62147 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SspnQ62147 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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