Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prm3Q62100 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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