Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2aQ62066 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms