Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms