Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctr9Q62018 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms