Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp2Q61990 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcbp2Q61990 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms