Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccne1Q61457 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms