Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf4bQ61136 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prpf4bQ61136 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prpf4bQ61136 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prpf4bQ61136 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prpf4bQ61136 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf4bQ61136 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf4bQ61136 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf4bQ61136 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf4bQ61136 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf4bQ61136 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf4bQ61136 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf4bQ61136 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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