Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ift20Q61025 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ift20Q61025 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ift20Q61025 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ift20Q61025 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ift20Q61025 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ift20Q61025 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ift20Q61025 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ift20Q61025 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ift20Q61025 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ift20Q61025 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ift20Q61025 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ift20Q61025 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ift20Q61025 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ift20Q61025 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ift20Q61025 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ift20Q61025 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ift20Q61025 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ift20Q61025 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ift20Q61025 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ift20Q61025 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ift20Q61025 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ift20Q61025 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ift20Q61025 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ift20Q61025 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ift20Q61025 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ift20Q61025 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ift20Q61025 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ift20Q61025 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ift20Q61025 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms