Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf8Q60846 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms