Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms