Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atf3Q60765 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.8 ms