Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SkiQ60698 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SkiQ60698 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SkiQ60698 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SkiQ60698 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SkiQ60698 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SkiQ60698 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SkiQ60698 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms