Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr2f1Q60632 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms