Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema5bQ60519 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sema5bQ60519 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms