Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scaf1Q5U4C3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Scaf1Q5U4C3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scaf1Q5U4C3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms