Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc125Q5U465 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms