Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabl6Q5U3K5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabl6Q5U3K5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabl6Q5U3K5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabl6Q5U3K5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabl6Q5U3K5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rabl6Q5U3K5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabl6Q5U3K5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabl6Q5U3K5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabl6Q5U3K5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabl6Q5U3K5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabl6Q5U3K5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabl6Q5U3K5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabl6Q5U3K5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabl6Q5U3K5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabl6Q5U3K5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabl6Q5U3K5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabl6Q5U3K5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabl6Q5U3K5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabl6Q5U3K5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabl6Q5U3K5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabl6Q5U3K5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabl6Q5U3K5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rabl6Q5U3K5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Rabl6Q5U3K5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rabl6Q5U3K5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rabl6Q5U3K5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rabl6Q5U3K5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rabl6Q5U3K5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms