Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NotoQ5TIS6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NotoQ5TIS6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms