Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsr1Q5SWD9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsr1Q5SWD9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms