Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc42Q5SV66 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc42Q5SV66 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms