Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Sco1Q5SUC9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Sco1Q5SUC9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Sco1Q5SUC9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Sco1Q5SUC9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Sco1Q5SUC9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sco1Q5SUC9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sco1Q5SUC9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sco1Q5SUC9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sco1Q5SUC9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sco1Q5SUC9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sco1Q5SUC9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sco1Q5SUC9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sco1Q5SUC9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sco1Q5SUC9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sco1Q5SUC9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sco1Q5SUC9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sco1Q5SUC9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms