Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tns3Q5SSZ5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tns3Q5SSZ5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Tns3Q5SSZ5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tns3Q5SSZ5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tns3Q5SSZ5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tns3Q5SSZ5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tns3Q5SSZ5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tns3Q5SSZ5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tns3Q5SSZ5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Tns3Q5SSZ5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tns3Q5SSZ5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tns3Q5SSZ5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tns3Q5SSZ5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tns3Q5SSZ5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tns3Q5SSZ5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tns3Q5SSZ5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tns3Q5SSZ5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tns3Q5SSZ5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tns3Q5SSZ5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tns3Q5SSZ5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Tns3Q5SSZ5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tns3Q5SSZ5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tns3Q5SSZ5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms