Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Utp18Q5SSI6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Utp18Q5SSI6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms