Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam46cQ5SSF7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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