Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r223Q5SSA0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r223Q5SSA0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r223Q5SSA0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r223Q5SSA0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r223Q5SSA0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r223Q5SSA0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r223Q5SSA0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms