Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlha9Q5RJB0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlha9Q5RJB0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms