Protein–RNA interactions for Protein: Q5M956

Kctd1, BTB/POZ domain-containing protein KCTD1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd1Q5M956 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kctd1Q5M956 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kctd1Q5M956 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Kctd1Q5M956 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms