Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Taf3Q5HZG4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf3Q5HZG4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 310 ms