Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SynaQ5G5D5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SynaQ5G5D5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms