Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ecm2Q5FW85 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ecm2Q5FW85 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ecm2Q5FW85 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ecm2Q5FW85 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ecm2Q5FW85 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ecm2Q5FW85 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ecm2Q5FW85 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ecm2Q5FW85 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms