Protein–RNA interactions for Protein: Q5F204

Mdh1b, Putative malate dehydrogenase 1B, mousemouse

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Length 500 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdh1bQ5F204 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mdh1bQ5F204 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Mdh1bQ5F204 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Mdh1bQ5F204 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mdh1bQ5F204 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms