Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkaa1Q5EG47 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms