Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfmbt2Q5DTW2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms