Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rtl5Q5DTT4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rtl5Q5DTT4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms