Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chsy3Q5DTK1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms