Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccnl1Q52KE7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccnl1Q52KE7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms