Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC17

Adamts18, A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Adamts18Q4VC17 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Adamts18Q4VC17 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Adamts18Q4VC17 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms