Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc84Q4VA36 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc84Q4VA36 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms