Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc3lQ4KL14 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms